3D Slicer Sample dataの読み込み方

小倉淳

記事内に商品プロモーションを含みます

こんにちは、個人事業OguLinks代表の小倉（@jun_ogulinks）です。

皆さん、3D Slicerはお使いでしょうか？

私は仕事上、3D Slicerが欠かせない存在となっています。

とは言え使いこなしているレベルではなく自分が使う機能のみを把握しているだけで、少しずつ自分が使える機能を増やしているといった段階です。

また、意外と使い方に関する日本語のソースが多くないようなので、私の周辺研究者へ使い方を伝えるツールとしてブログを活用していこうかと思います。

医学生物系研究者だけでなく他分野のユーザーにも役に立つ情報かと。

この記事を皮切りに3D Slicerの使い方について記事を投稿していきます。

Contents

3D Slicer Sample Dataの呼び出し方
3D Slicer Sample Dataの利用における注意点
まとめ

3D Slicer Sample Dataの呼び出し方

この記事では3D Slicer バージョン5の使用を前提に話を進めていきます。

3D Slicer起動後、メニューバー＞File＞Download Sample Data をクリックします。

すると下図のように利用できるサンプルデータ一覧が表示されます。

画像サムネイルとキャプションを見ればだいたいどのようなデータなのかイメージが付くのではないかと思います。

使用したいサンプルデータを見つけたら、そのサムネイル画像をクリックします。

ここでは試しに ” MRBrainTumor1 ” を選択してみます。

するとすぐにデータの読み込みが始まり、下部のステータス欄（サムネイル画像一覧をスクロールすると一番下にステータス欄があります）が下図のような表示になっていればサンプルデータが使えるようになっています。

他のサンプルデータも使いたいということであれば連続で複数のデータを読み込むことも可能です。

3D Slicer Sample Dataの利用における注意点

サンプルデータ使用にあたっていくつかライセンスが付与されているようなので注意しましょう。

以下はサンプルデータのAcknowledgmentに記載されているものです。

This work was was funded by Cancer Care Ontario and the Ontario Consortium for Adaptive Interventions in Radiation Oncology (OCAIRO) MRHead, CBCT-MR Head, and CT-MR Brain data sets were donated to 3D Slicer project by the persons visible in the images, to be used without any restrictions.

CTLiver dataset comes from Medical Decathlon project (imagesTr/liver_100.nii.gz in Task03_Liver collection) with a permissive copyright-license (CC-BY-SA 4.0), allowing for data to be shared, distributed and improved upon.

CTA abdomen (Panoramix) dataset comes from Osirix DICOM image library and is exclusively available for research and teaching. You are not authorized to redistribute or sell it, or use it for commercial purposes.

Contributors: Steve Pieper (Isomics), Benjamin Long (Kitware), Jean-Christophe Fillion-Robin (Kitware)

3D Slicer サンプルデータのAcknowledgmentより

内容をまとめると次のようになります。